NetCommons2（NC2）のヴァージョンアップとリストアを同時に出来ないか、一生懸命調べていました。
かなり時間がかかりましたが、何とか出来ました！！
最新ヴァージョンを新規インストールして、その新環境にリストアしようという訳です。
この記録はリストア直後の深夜に書き始めたんですが、
記録した手順通りで本当に出来るのか、次の日に再実験したところ、やっぱりひっかかってしまいました・・・

そこで、再度確認しながら、少しずつ作業を進めていきました。
今度こそ　・・・　出来ました！！　
次からもこれでOKです。
このサイトは、今回のリストアで出来たものです。
以下、覚え書きです。

＜旧サイトでの作業＞

①サイトを閲覧不可にする。

②国立情報学研究所NCサイトを参照し、旧サイトにアップデートモジュールを適用しておく。
（アップデートがある場合のみの作業）

③旧サイトで固定リンクを解除後、フルバックアップを実施。

④クライアントPCに③のフルバックアップファイルをダウンロード。
このバックアップファイルは半角英字にリネームしておく。
（日本語環境にしていないサーバーにアップロードするとファイル名が文字化けする）

＜新サイトでの作業＞
⑤新サーバにmysql新仮データベース（db）作成。
mysqlのdb名、ユーザ名は旧サイトと同じでなくて良い。

⑥新サーバに新ヴァージョンNC2を新規インストール。
mysqlテーブルの接頭語（プレフィックス）は旧サイトのものと同じにする。
プレフィックス最後のアンダーバー（_）に注意。プレフィックスを指定する時に（_）を入力しなくても（_）は設定される。この誤りがdbに接続できない原因になる事が多かった。
（NC2インストールは、テクネコさんのマニュアル nc_install.pdf　が参考になる。やや古くCentOS対応ですが）

⑦新サーバ任意ディレクトリ（/home 等）に④のフルバックアップファイルをアップロードし、解凍。

⑧新サイトの webapp/uploadsディレクトリ を削除し、⑦の解凍ファイル中のwebapp/uploadsディレクトリ（旧サイト）で置き換える。
置き換えたuploadsフォルダ、フォルダ下のファイルの user、group は共にwww-data、アクセス権は775に変更しておく。

⑨新サイトのdbを旧サイトの内容にリストアする。
具体的には、
　（１）インストール時の新仮db削除
　まず、mysqlにログイン
　　#mysql -u root -p
　　mysql > drop database 〇〇〇；
　（２）新規db作成
　　mysql > create database △△△ default character set utf8；
　（３）バックアップダンプファイルをインポート
　　mysql >use △△△；
　　mysql >set names utf8；
　　mysql >source /home/bk/backup_full.sql；
　　　(バックアップファイルを解凍したディレクトリが /home/bk の場合)

⑩新サイトにログインして、モジュールを一括アップデート。

⑪新サイトを、閲覧可に戻す。

⑫元のフルバックアップファイル削除。
ダウンロード、アップロード、解凍したファイルをすべて削除しておきます。

※あらかじめリストアしたdbを作っておいて、NCインストール時にdbに接続しようとしましたが、これはdbに接続できず上手くいきませんでした。
また、mysql -u root -p 新db名 < backup_full.sql でdbインポートも上手くいきませんでしたが、これは再試行してみたいと思っています。

以上です！